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Allele data for marker "STS006" from the experiment "Genome-wide patterns of nucleotide polymorphism in domesticated rice".

E.g., Germplasm "IRGC9542", RA4969, Basmati 1, Marker/locus RM22.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

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Stock
Number

Locus
name
Genotype
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Germplasm
ARC 13829 IRGC42469     RA4947 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "ARC 13829" genotypes
Basmati 217 IRGC53637     RA4993 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Basmati 217" genotypes
DA13 IRGC5857     RA4887 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "DA13" genotypes
Dom Sufid IRGC12880 aromatic   RA4929 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Dom Sufid" genotypes
DV85 IRGC8839     RA5323 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "DV85" genotypes
Pankhari 203 IRGC5999     RA4888 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Pankhari 203" genotypes
BJ1 IRGC45195     RA5345 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "BJ1" genotypes
Dhala Shaitta PI180060     RA5361 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
CAGCTTGTGATGAAGAAGTCAAGCGCTCATGATGGGCTCGTGAAGGGGCT
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GTTTGCAGCTTT
View all "Dhala Shaitta" genotypes
Davao IRGC8244 japonica   RA4901 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Davao" genotypes
Jhona 349 IRGC6307     RA4979 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Jhona 349" genotypes
Kasalath HO1195     RA5339 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Kasalath" genotypes
Phudugey IRGC32399     RA4939 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Phudugey" genotypes
9311 RA5531 indica   RA5531 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "9311" genotypes
Ai-Chiao-Hong IRGC51250 indica   RA4967 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Ai-Chiao-Hong" genotypes
Badkalamkati IRGC45011 indica   RA4991 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Badkalamkati" genotypes
Binulawan IRGC26872 indica   RA4871 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Binulawan" genotypes
Cere Air IRGC43369 indica   RA4953 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Cere Air" genotypes
Chau IRGC56036 indica   RA4974 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Chau" genotypes
Chhote Dhan IRGC58930 indica   RA4978 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Chhote Dhan" genotypes
Gundil Kuning IRGC16428 japonica   RA5297 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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NNTTGCANNNTT
View all "Gundil Kuning" genotypes
Guan-Yin-Tsan IRGC51300 indica   RA4968 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Guan-Yin-Tsan" genotypes
Hsia-Chioh-Keh-Tu IRGC8240 indica   RA4898 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Hsia-Chioh-Keh-Tu" genotypes
Jefferson x Oryza rufipogon NULL     Jefferson x Oryza rufipogon BC2F2 Line 252 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Jefferson x Oryza rufipogon" genotypes
Mudgo IRGC6663 indica   RA5282 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
CAGCTTGTGATGAAGAAGTCAAGCGCTCATGATGGGCTCGTGAAGGGGCT
CCGTGAGGCGGCCAAGGCCATTGAGAAGCATGCCGCTCAGCTTTGCGTGC
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GTCAATTGTTATACTGTGTTAATCTGATGTCTAGGCTGCCGGATAAGATT
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AATGTGCTATTTAATTTTGTAATCCTTTATCTAAATTTTAATTTCATTTT
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GTTTGCAGCTTT
View all "Mudgo" genotypes
Khao Dawk Mali 105 IRGC27748 indica   RA4878 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
CAGCTTGTGATGAAGAAGTCAAGCGCTCATGATGGGCTCGTGAAGGGGCT
CCGTGAGGCGGCCAAGGCCATTGAGAAGCATGCCGCTCAGCTTTGCGTGC
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TGGCGAGTGGGCAGGGGTGAGATACATTACTCTTCTATTAGCTGTACCTT
GTCAATTGTTATACTGTGTTAATCTGATGTCTAGGCTGCCGGATAAGATT
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AATGTGCTATTTAATTTTGTAATCCTTTATCTAAATTTTAATTTCATTTT
GTTGTTGATATTGTTCTGCATCTCTCCTTTCTGCATATCTTCTGATT---
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GTTTGCAGCTTT
View all "Khao Dawk Mali 105" genotypes
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