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Allele data for marker "STS052" from the experiment "Genome-wide patterns of nucleotide polymorphism in domesticated rice".

E.g., Germplasm "IRGC9542", RA4969, Basmati 1, Marker/locus RM22.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

Country of
Origin

Stock
Number

Locus
name
Genotype
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Germplasm
ARC 13829 IRGC42469     RA4947 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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AAAAGTAGAATACCCC
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Basmati 217 IRGC53637     RA4993 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
GAAGAAGTAGTGAAGTTACTGAAGGTGAATGCGCCCTGCGAAACCAAGAA
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View all "Basmati 217" genotypes
DA13 IRGC5857     RA4887 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
GAA---GTAGTGAAGTTACTGAAGGTGAATGCGCCCTGCGAAACCAAGAA
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Dom Sufid IRGC12880 aromatic   RA4929 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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DV85 IRGC8839     RA5323 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
GAA---GTAGTGAAGTTACTGAAGGTGAATGCGCCCTGCGAAACCAAGAA
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Pankhari 203 IRGC5999     RA4888 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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BJ1 IRGC45195     RA5345 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Dhala Shaitta PI180060     RA5361 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
GAAGAAGTAGTGAAGTTACTGAAGGTGAATGCTCCCTGCGAAACCAAGAA
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Davao IRGC8244 japonica   RA4901 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Jhona 349 IRGC6307     RA4979 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Phudugey IRGC32399     RA4939 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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9311 RA5531 indica   RA5531 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Ai-Chiao-Hong IRGC51250 indica   RA4967 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Badkalamkati IRGC45011 indica   RA4991 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Binulawan IRGC26872 indica   RA4871 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Cere Air IRGC43369 indica   RA4953 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Chau IRGC56036 indica   RA4974 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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Chhote Dhan IRGC58930 indica   RA4978 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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View all "Chhote Dhan" genotypes
Gundil Kuning IRGC16428 japonica   RA5297 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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View all "Gundil Kuning" genotypes
Guan-Yin-Tsan IRGC51300 indica   RA4968 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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View all "Guan-Yin-Tsan" genotypes
Hsia-Chioh-Keh-Tu IRGC8240 indica   RA4898 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACAAGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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View all "Hsia-Chioh-Keh-Tu" genotypes
Jefferson x Oryza rufipogon NULL     Jefferson x Oryza rufipogon BC2F2 Line 252 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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View all "Jefferson x Oryza rufipogon" genotypes
Mudgo IRGC6663 indica   RA5282 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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View all "Mudgo" genotypes
Khao Dawk Mali 105 IRGC27748 indica   RA4878 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
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AAAAGTAGAATACCCC
View all "Khao Dawk Mali 105" genotypes
Lal Aman IRGC46202 indica   RA4956 STS052 AGTACGACGCAACGGCCGCACCACACGGTGCAGACTACCACAAGTGCAGA
GAAGAAGTAGTGAAGTTACTGAAGGTGAATGCGCCCTGCGAAACCAAGAA
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AAAAGTAGAATACCCC
View all "Lal Aman" genotypes
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