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Allele data for marker "LDregion1A" from the experiment "Hamblin et al. (2005) Equilibrium Processes Cannot Explain High Levels of Short- and Medium-Range Linkage Disequilibrium in the Domesticated Grass Sorghum bicolor. Genetics 171: 1247-1256.".

E.g., Germplasm L-WA58, Marker/locus pSB0080.

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Germplasm
L-WA12   drummondii, NULL South Africa   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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L-WA13   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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L-WA22   arundinaceum, NULL Angola   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGGGAGTTCTACTATACTTTTGTTGGACTGATCATT
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L-WA28   arundinaceum, NULL Angola   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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L-WA42   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGGGAGTTCTACTATACTTTTGTTGGACTGATCATT
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L-WA55   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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L-WA88   arundinaceum, NULL Egypt   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGGGAGTTCTACTATACTTTTGTTGGACTGATCATT
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65I 1502   bicolor, NULL Nigeria   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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65I 1793   bicolor, NULL Mali   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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65I 2133   bicolor, NULL India   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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65I 2165   bicolor, NULL South Africa   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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65I 2604   bicolor, NULL India   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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66I 4680   bicolor, NULL Uganda   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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Purdue No. 49506   bicolor, NULL Cameroon   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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74I 10917   bicolor, NULL India   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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PI213900   bicolor, NULL Kenya   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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PI221540   bicolor, NULL Nigeria   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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PI221607   bicolor, NULL Nigeria   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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PI267523   bicolor, NULL Egypt   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
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PI267525   bicolor, NULL Egypt   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
GTAAAGATTTGTTCAAATAGGGTCATCTTAATTGTTTGAAATCTGGGAAC
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PI287624   bicolor, NULL Zimbabwe   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
GTAAAGATTTGTTCAAATAGGGTCATCTTAATTGTTTGAAATCTGGGAAC
TGTGGCTTCACTGCACTCAGGAAAAGGCAATTCATGGTTATGGCATGAAT
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GCAACTTTTAGTTGCGTTAAAAAAAACCCCTGTAACTCTTAGACCACTCA
CCACTGTAATCTTTCCTGAATTTTTGTTTAATGGCATGTATAAACTCACC
ACTTATGTACTTATCTAGGAAAAAATAGTCTAACTCTGTGCCCCATGTTT
GCAGCATTTTCAAACACAGTCCTCTAGAAAAAGTTATGCTGATGCAAACC
ATGTATCTGCTATCATTTTGGGTGGAGGCACTGGATCTCAGCTCTTTCCT
CTGACAAGCACAAGAGCTACGCCTGCTGTAAGAGATAACATTGAACATCA
AATGTTGATTACTCTATTATAGTATTATACAGAATATAAATTTCGAATTT
ATCTTAGTTTTGTACAGTATTTAGTGGATTCTTCTCATTTTCAAGATACA
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TCTTTTGGGAGACTTTCAGTCAAAATTTCTTAGAAGGTTTTTTGGTCCAG
ATGTTCTGATACCTTATTTTTT
View all "PI287624" genotypes
PI510906   bicolor, NULL Botswana   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
GTAAAGATTTGTTCAAATAGGGTCATCTTAATTGTTTGAAATCTGGGAAC
TGTGGCTTCACTGCACTCAGGAAAAGGCAATTCATGGTTATGGCATGAAT
AACTTATGGAAATAGACCTTAGAGTTGCTGCATGATTGTCACAAATCATT
GCTATGATATCTTATAATAGTTCTTTCTACTTTGCATTACATGTATAACT
GCAACTTTTAGTTGCGTTAAAAAAAACCCCTGTAACTCTTAGACCACTCA
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GCAGCATTTTCAAACACAGTCCTCTAGAAAAAGTTATGCTGATGCAAACC
ATGTATCTGCTATCATTTTGGGTGGAGGCACTGGATCTCAGCTCTTTCCT
CTGACAAGCACAAGAGCTACGCCTGCTGTAAGAGATAACATTGAACATCA
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TCTTTTGGGAGACTTTCAGTCAAAATTTCTTAGAAGGTTTTTTGGTCCAG
ATGTTCTGATACCTTATTTTTT
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L-WA71   drummondii, NULL South Africa   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
GTAAAGATTTGTTCAAATAGGGTCATCTTAATTGTTTGAAATCTGGGAAC
TGTGGCTTCACTGCACTCAGGAAAAGGCAATTCATGGTTATGGCATGAAT
AACTTATGGAAATAGACCTTAGAGTTGCTGCATGATTGTCACAAATCATT
GCTATGATATCTTATAATAGTTCTTTCTACTTTGCATTACATGTATAACT
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GCAGCATTTTCAAACACAGTCCTCTAGAAAAAGTTATGCTGATGCAAACC
ATGTATCTGCTATCATTTTGGGTGGAGGCACTGGATCTCAGCTCTTTCCT
CTGACAAGCACAAGAGCTACGCCTGCTGTAAGAGATAACATTGAACATCA
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ATCTTAGTTTTGTACAGTATTTAGTGGATTCTTCTCATTTTCAAGATACA
CAATTGAACCATAATTGAAGTATGTAAGACAGCCAGTTAAAAAACTATAT
TCTTTTGGGAGACTTTCAGTCAAAATTTCTTAGAAGGTTTTTTGGTCCAG
ATGTTCTGATACCTTATTTTTT, CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTAC
TATACTTCTGTTGGACTGATCATTGTAAAGATTTGTTCAAATAGGGTCAT
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GCAATTCATGGTTATGGCATGAATAACTTATGGAAATAGACCTTAGAGTT
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CTACTTTGCATTACATGTATAACTGCAACTTTTAGTTGCGTTAAAAAAAA
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GAAAAAGTTATGCTGATGCAAACCATGTATCTGCTATCATTTTGGGTGGA
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TTCTTAGAAGGTTTTTTGGTCCAGATGTTCTGATACCTTATTTTTT
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65I 1633   bicolor, NULL Chad   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
GTAAAGATTTGTTCAAATAGGGTCATCTTAATTGTTTGAAATCTGGGAAC
TGTGGCTTCACTGCACTCAGGAAAAGGCAATTCATGGTTATGGCATGAAT
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GCTATGATATCTTATAATAGTTCTTTCTACTTTGCATTACATGTATAACT
GCAACTTTTAGTTGCGTTAAAAAAAACCCCTGTAACTCTTAGACCACTCA
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ACTTATGTACTTATCTAGGAAAAAATAGTCTAACTCTGTGCCCCATGTTT
GCAGCATTTTCAAACACAGTCCTCTAGAAAAAGTTATGCTGATGCAAACC
ATGTATCTGCTATCATTTTGGGTGGAGGCACTGGATCTCAGCTCTTTCCT
CTGACAAGCACAAGAGCTACGCCTGCTGTAAGAGATAACATTGAACATCA
AATGTTGATTACTCTATTATAGTATTATACAGAATATAAATTTCGAATTT
ATCTTAGTTTTGTACAGTATTTAGTGGATTCTTCTCATTTTCAAGATACA
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TCTTTTGGGAGACTTTCAGTCAAAATTTCTTAGAAGGTTTTTTGGTCCAG
ATGTTCTGATACCTTATTTTTT
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69I 7471   bicolor, NULL Uganda   LDregion1A CTTTTTGTGTTTTGAGAGAGTTCTACTATACTTCTGTTGGACTGATCATT
GTAAAGATTTGTTCAAATAGGGTCATCTTAATTGTTTGAAATCTGGGAAC
TGTGGCTTCACTGCACTCAGGAAAAGGCAATTCATGGTTATGGCATGAAT
AACTTATGGAAATAGACCTTAGAGTTGCTGCATGATTGTCACAAATCATT
GCTATGATATCTTATAATAGTTCTTTCTACTTTGCATTACATGTATAACT
GCAACTTTTAGTTGCGTTAAAAAAAACCCCTGTAACTCTTAGACCACTCA
CCACTGTAATCTTTCCTGAATTTTTGTTTAATGGCATGTATAAACTCACC
ACTTATGTACTTATCTAGGAAAAAATAGTCTAACTCTGTGCCCCATGTTT
GCAGCATTTTCAAACACAGTCCTCTAGAAAAAGTTATGCTGATGCAAACC
ATGTATCTGCTATCATTTTGGGTGGAGGCACTGGATCTCAGCTCTTTCCT
CTGACAAGCACAAGAGCTACGCCTGCTGTAAGAGATAACATTGAACATCA
AATGTTGATTACTCTATTATAGTATTATACAGAATATAAATTTCGAATTT
ATCTTAGTTTTGTACAGTATTTAGTGGATTCTTCTCATTTTCAAGATACA
CAATTGAACCATAATTGAAGTATGTAAGACAGCCAGTTAAAAAACTATAT
TCTTTTGGGAGACTTTCAGTCAAAATTTCTTAGAAGGTTTTTTGGTCCAG
ATGTTCTGATACCTTATTTTTT
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