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Allele data for marker "LDregion5B" from the experiment "Hamblin et al. (2005) Equilibrium Processes Cannot Explain High Levels of Short- and Medium-Range Linkage Disequilibrium in the Domesticated Grass Sorghum bicolor. Genetics 171: 1247-1256.".

E.g., Germplasm L-WA58, Marker/locus pSB0080.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

Country of
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Stock
Number

Locus
name
Genotype
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Germplasm
L-WA12   drummondii, NULL South Africa   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "L-WA12" genotypes
L-WA28   arundinaceum, NULL Angola   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "L-WA28" genotypes
L-WA42   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "L-WA42" genotypes
L-WA55   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "L-WA55" genotypes
L-WA88   arundinaceum, NULL Egypt   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "L-WA88" genotypes
65I 1502   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "65I 1502" genotypes
65I 1793   bicolor, NULL Mali   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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65I 2133   bicolor, NULL India   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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65I 2165   bicolor, NULL South Africa   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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65I 2604   bicolor, NULL India   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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66I 4680   bicolor, NULL Uganda   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "66I 4680" genotypes
Purdue No. 49506   bicolor, NULL Cameroon   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "Purdue No. 49506" genotypes
74I 10917   bicolor, NULL India   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "74I 10917" genotypes
PI213900   bicolor, NULL Kenya   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "PI213900" genotypes
PI221540   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "PI221540" genotypes
PI221607   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "PI221607" genotypes
PI267523   bicolor, NULL Egypt   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "PI267523" genotypes
PI267525   bicolor, NULL Egypt   LDregion5B nnnnnnnnnnnnnnnnGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "PI267525" genotypes
PI287624   bicolor, NULL Zimbabwe   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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CTGAGAATCCAAAAAATATTTGGACCAAA
View all "PI287624" genotypes
PI510906   bicolor, NULL Botswana   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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CTGAGAATCCAAAAAATATTTGGACCAAA
View all "PI510906" genotypes
PI510985   bicolor, NULL Botswana   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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View all "PI510985" genotypes
L-WA71   drummondii, NULL South Africa   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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CTGAGAATCCAAAAAATATTTGGACCAAA
View all "L-WA71" genotypes
PI221655   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
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CTGAGAATCCAAAAAATATTTGGACCAAA
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65I 1633   bicolor, NULL Chad   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
AGATCCTTTAATCGTCTCATACTTTC-AAAGATCAAA-TTTCTGTTTACA
CTTTATGCTGAGGACTATGTATGTCAACAACATAATAAAAATGCCTTAAA
GACAGTACTGGTTACAGCACATAAAAATAATACAGAACTGATAGGATTT-
TTTTAGCATTGAGACATCTGCAAGAACTTAAGGGAATCAAATTCTAAATA
AAAGAACCATATGTGCTGAACGTGTTCAGTTAAACGGTTATCCCTCCATC
CCAAATTATAGGTCGTTTTGGTTTTTCTAGATACATAATAATAATAAGAA
AAATGTATATCTAAAAAAAGCCAAAACGGACTATAATTTGGAATGGAGGG
AGCATATGCTAAACATTAAGTCACTCATTCTTAGCCAAAAAGTAGGCTAC
AGGTCCTAAACGTCCATTTAATCAGCCCAAAAAGACCTTTTAGCGTTTAT
ATGATGTTTAATCAGCCTAAACACAATTGAACATAAATAAATATTTTCAA
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TGCCTTATGAGTTATGAAGCAAACCATACAGCAGACAAGTCAGTGAGAGA
CTGAGAATCCAAAAAATATTTGGACCAAA
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69I 7471   bicolor, NULL Uganda   LDregion5B AGATGCATTCAGGTATGCATGCAGTGTGTTGGCAGTTTGAATAGTGGCTC
AGATCCTTTAATCATCTCATACTTTCAAAAGATCATATTTTCTGTTTACA
CTTTATGCTGAGGACTATGTATGTCAACAACATAATAAAAATGCCTTAAA
GATAGTACTGGTTACAGCACATAAAAA-AATACAGAACTGATAGGATTTC
TTTTAGCATTGAGACAACTGCAAGAACTTAAGGGAATCAAATTCTAAATA
AAAGAACCATATGTGCTGAAAGTGTTCAGTTAAACGGTTCTCCATCCG--
--AAATTATAGGCCGTTTTGGTTTTTCCAGATAC---------ATAAGAA
AAATGTATATCTAAAAAAAGCCAAAACAGACTATAATTTGGAACAGAGGG
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AGGTCCTAAACGTCCATTTAGTCAGCCCAAAAAGACCTTTTAGCGTTTAT
ATGATGTTTAATCAGCCTAAACACAATTGAACATAAATAAACATCTTCAA
GGTGTACTTTTCGGAAATTTCCAAACTGTAGATTATGATTTAAGACTAGA
TGCCTTATGAGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAGTGAGAGA
CTGAGAATCCAAAAAATATTTGGACCAAA
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