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Allele data for marker "LDregion5D" from the experiment "Hamblin et al. (2005) Equilibrium Processes Cannot Explain High Levels of Short- and Medium-Range Linkage Disequilibrium in the Domesticated Grass Sorghum bicolor. Genetics 171: 1247-1256.".

E.g., Germplasm L-WA58, Marker/locus pSB0080.

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Germplasm
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Germplasm
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name
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Germplasm
L-WA12   drummondii, NULL South Africa   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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L-WA13   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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L-WA22   arundinaceum, NULL Angola   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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L-WA28   arundinaceum, NULL Angola   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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L-WA42   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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L-WA55   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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L-WA88   arundinaceum, NULL Egypt   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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65I 1502   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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65I 1793   bicolor, NULL Mali   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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65I 2133   bicolor, NULL India   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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65I 2165   bicolor, NULL South Africa   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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65I 2604   bicolor, NULL India   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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66I 4680   bicolor, NULL Uganda   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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Purdue No. 49506   bicolor, NULL Cameroon   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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View all "Purdue No. 49506" genotypes
74I 10917   bicolor, NULL India   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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View all "74I 10917" genotypes
PI213900   bicolor, NULL Kenya   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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View all "PI213900" genotypes
PI221540   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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View all "PI221540" genotypes
PI221607   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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View all "PI221607" genotypes
PI267523   bicolor, NULL Egypt   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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View all "PI267523" genotypes
PI267525   bicolor, NULL Egypt   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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View all "PI267525" genotypes
PI287624   bicolor, NULL Zimbabwe   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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TGCTTTCAACTTTTTTTTT-CCTTGGAGATAAATAATTATGGCCTTCTAT
GCAGTTTGATGCACTTGTTGCGGCATTGCCACTATCATCAGAAGAGGATC
AAGTGAAAAGAATCCAAGAGCTACAGGTAGATATCTGACAGTCAGATTAA
TTTATCGAGCACTGATTTTTCAAGGATGGGCATCTGTCAAGCTCCTCCAT
TAAATTGTATATGAACTTAAAATTTG
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PI510906   bicolor, NULL Botswana   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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TGACAATACTGAATGTCTGCCACTGAAACTGTGTTGCCACTTACAAAGCC
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CTGTTGTTTGTGTTAACCATAGTTGAAACGTGTTGTAAAATATGGAGTAG
ACTATTCCGTTGCCTAACAAACTTTAGTTCAAAATGTGCTCGCTGTGA-T
TGCTTTCAACTTTTTTTTT-CCTTGGAGATAAATAATTATGGCCTTCTAT
GCAGTTTGATGCACTTGTTGCGGCATTGCCACTATCATCAGAAGAGGATC
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TTTATCGAGCACTGATTTTTCAAGGATGGGCATCTGTCAAGCTCCTCCAT
TAAATTGTATATGAACTTAAAATTTG
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PI510985   bicolor, NULL Botswana   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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TGACAATACTGAATGTCTGCCACTGAAACTGTGTTGCCACTTACAAAGCC
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TAAATTGTATATGAACTTAAAATTTG
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L-WA71   drummondii, NULL South Africa   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
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TAAATTGTATATGAACTTAAAATTTG
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PI221655   bicolor, NULL Nigeria   LDregion5D CTCTTCTCGGCCTCCCCCACCTGCTCGACCGAATGCCCAGCTGGGGATTC
CAAAATGTCTCTGCGTGTGTGGTTACGGCGAAGGTTTCGGATCGTCTCGT
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TGACAATACTGAATGTCTGCCACTGAAACTGTGTTGCCACTTACAAAGCC
TTCATCTCTTGCTTATCCATTGCATAAGATTTTTAGTCCAGTAGTTGTAC
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CTGTTGTTTGTGTTAACCATAGTTGAAACGTGTTGGAAAATATGGAGTAG
ACTATTCCGTTGCCTAACAAACTTTAGTTCAAAATGTGCTCGCTGTGA-T
TGCTTTCAACTTTTTTTTT-CCTTGGAGATAAATAATTATGGCCTTCTAT
GCAGTTTGATGCACTTGTTGCGGCATTGCCACTATCATCAGAAGAGGATC
AAGTGAAAAGAATCCAAGAGCTACAGGTAGATATCTGACAGTCAGATTAA
TTTATCGAGCACTGATTTTTCAAGGATGGGCATCTGTCAAGCTCCTCCAT
TAAATTGTATATGAACTTAAAATTTG
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