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Allele data for marker "LDregion6C" from the experiment "Hamblin et al. (2005) Equilibrium Processes Cannot Explain High Levels of Short- and Medium-Range Linkage Disequilibrium in the Domesticated Grass Sorghum bicolor. Genetics 171: 1247-1256.".

E.g., Germplasm L-WA58, Marker/locus pSB0080.

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Germplasm
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Germplasm
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& subtaxa

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Number

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name
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Germplasm
L-WA13   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "L-WA13" genotypes
L-WA22   arundinaceum, NULL Angola   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "L-WA22" genotypes
L-WA28   arundinaceum, NULL Angola   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCTTTTCAGATTGCT
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View all "L-WA28" genotypes
L-WA42   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "L-WA42" genotypes
L-WA55   arundinaceum, NULL South Africa   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "L-WA55" genotypes
65I 1502   bicolor, NULL Nigeria   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "65I 1502" genotypes
65I 1793   bicolor, NULL Mali   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "65I 1793" genotypes
65I 2133   bicolor, NULL India   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "65I 2133" genotypes
65I 2165   bicolor, NULL South Africa   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "65I 2165" genotypes
65I 2604   bicolor, NULL India   LDregion6C CACCCAATCGCCAATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "65I 2604" genotypes
66I 4680   bicolor, NULL Uganda   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
CTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCAAGTCTAGT
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View all "66I 4680" genotypes
Purdue No. 49506   bicolor, NULL Cameroon   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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TAAAAG
View all "Purdue No. 49506" genotypes
PI213900   bicolor, NULL Kenya   LDregion6C ----------------------------------GCCGTTTCAGATTGCT
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TATTA
View all "PI213900" genotypes
PI221540   bicolor, NULL Nigeria   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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TAAAAG
View all "PI221540" genotypes
PI221607   bicolor, NULL Nigeria   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "PI221607" genotypes
PI267523   bicolor, NULL Egypt   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "PI267523" genotypes
PI267525   bicolor, NULL Egypt   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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TAAAAG
View all "PI267525" genotypes
PI287624   bicolor, NULL Zimbabwe   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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View all "PI287624" genotypes
PI510906   bicolor, NULL Botswana   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
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TTGGCACTAATTTTCTAATTATCACCAAAAATCCAGGTATGGTCAGCCAA
TAAAAG
View all "PI510906" genotypes
PI510985   bicolor, NULL Botswana   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
CTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCAAGTCTAGT
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TTGGCACTAATTTTCTAATTATCACCAAAAATCCAGGTATGGTCAGCCAA
TAAAAG
View all "PI510985" genotypes
L-WA71   drummondii, NULL South Africa   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
CTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCAAGTCTAGT
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TTGGCACTAATTTTCTAATTATCACCAAAAATCCAGGTATGGTCAGCCAA
TAAAAG
View all "L-WA71" genotypes
PI221655   bicolor, NULL Nigeria   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
CTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCAAGTCTAGT
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TTGGCACTAATTTTCTAATTATCACCAAAAATCCAGGTATGGTCAGCCAA
TAAAAG
View all "PI221655" genotypes
65I 1633   bicolor, NULL Chad   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
CTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCAAGTCTAGT
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TTGGCACTAATTTTCTAATTATCACCAAAAATCCAGGTATGGTCAGCCAA
TAAAAG
View all "65I 1633" genotypes
69I 7471   bicolor, NULL Uganda   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
CTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCAAGTCTAGT
TACCATGGGAATACACATGTGTAACATGCTTTGCATATTTTCATTTTCAT
GGTCTTAGGCTCTTGTTTTGATGAATTAAATGCCTGCATTAATTCTTTCA
ATACTTTCTGCTAAGTTTGAGTTATCTTGTGCTTAATTGTATATTAGCTG
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CTAGGTGGGCATAAGAGTTTCATTGCTATTCATGTTAGTTTTTAAAAGTG
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TTGGCACTAATTTTCTAATTATCACCAAAAATCCAGGTATGGTCAGCCAA
TAAAAG, CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTC
AGATTGCTCTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCA
AGTCTAGTTACCATGGGAATACACATGTGTAACATGCTTTGCATATTTTC
ATTTTCATGGTCTTAGGCTCTTGTTTTGATGAATTAAATGCCTGCATTAA
TTCTTTCAATACTTTCTGCTAAGTTTGAGTTATCTTGTGCTTAATTGTAT
ATTAGCTGTATTAAAAGCACTGTGATACATAAAAATTTT--TTTAGTCAC
TTGAAAATATTAAGAGAAATTTAGTTATCGGGGAGAAGGGGAGGGGATTG
GGTTGGGTTTTGATTCTCCCTTTTTAATTGTAGATATTATGCTAAGTCTT
TTTTAGGAACAAAAGTTCAATTTCAGCTGGCTGACTACAATCAGCGGTGT
GCTAATCTTCTTTTACTGGAATGAAAGCACACATGCAGTTCAGCCTAACC
TATTT-ATCTAGGTGGGCATAAGAGTTTCATTGCTATTCATGTTAGTTTT
TAAAAGTGTGATGAGTGCAATATGGTGAATTGAGATAGCATCGGGGAGCT
GAGCCATGTATGTTACTGTGGTTTGACTTGTGGTGTGCTGTAGACTAATT
TATT-GACATGTGCTTCCATACCCATCTCTAAATTATTATGCTGTACTAT
CAGTTCAAACACATATGAGAATTAAACGTTTGTGGTTAAAACTGATCCAT
CCATTCTGTAGTTGTTGTCTACCGCCTTTTAGAATTTAGAGTGACACCTT
TCGACTAGCATATATATCAGGGAGTTGGGAGAATGCCATAGTTAGAACTT
AGAAGCTATTAGATGCAAGGGACATTTTGAATGTGAGACATTTATTTTAT
TGGCTAAACTTTGAATGAATGAAAATAATTATGATTTTAAGTATGGTTGT
TCTAGTGCTGCCAAGGATTAGGATACCTTAATTTGGGATACTAGGTTTGC
TTATCCTCTATAAATTACATTGTTTATTAGCAATGTGGCCTTAACACTTT
CCATTCTGATGTTGCAGTCATCCTTTGGTTTCATTGACTACTATGACCGC
AGATATGCTGCACTAGCAATTTTATCTCTCAATGGCAGACCACTGTAAGC
TTTTTGGTTTTGTATTCCCTCCATTTGTAATTGTAAGTCGTTTTGGCTTT
TCTAGATTCATAGGTGTATAGCAAAACTATGTACCTAGAAAAGCCAAAAT
AACTTGCAATTGGAATGGAAGGAGTATGTGCTAATTTCTATGATCACTGC
CCTGTTTTTTGGCACTAATTTTCTAATTATCACCAAAAATCCAGGTATGG
TCAGCCAATAAAAG
View all "69I 7471" genotypes
PI152702   bicolor, NULL Sudan   LDregion6C CACCC-------AATCGCCTGAAAAATTGTGGCTGCCGTTTCAGATTGCT
CTCTGCATCTGATTTTTGGCTTTGCTTTACCTGCATGTCTCAAGTCTAGT
TACCATGGGAATACACATGTGTAACATGCTTTGCATATTTTCATTTTCAT
GGTCTTAGGCTCTTGTTTTGATGAATTAAATGCCTGCATTAATTCTTTCA
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TAAAAG
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