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Allele data for marker "lga10" from the experiment "Hamblin, Casa, et al. (2006) Challenges of Detecting Directional Selection After a Bottleneck: Lessons From Sorghum bicolor. Genetics 173: 953-964.".

E.g., Germplasm L-WA58, Marker/locus pSB0080.

Items 1 to 17 of 17.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

Country of
Origin

Stock
Number

Locus
name
Genotype
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Germplasm
65I 1633   bicolor, NULL Chad   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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View all "65I 1633" genotypes
65I 1791   bicolor, NULL Mali   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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View all "65I 1791" genotypes
65I 2133   bicolor, NULL India   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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View all "65I 2133" genotypes
66I 4156   bicolor, NULL Algeria   lga10 CTATGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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View all "66I 4156" genotypes
66I 4961   bicolor, NULL Kenya   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "66I 4961" genotypes
66I 5133   bicolor, NULL Ethiopia   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "66I 5133" genotypes
69I 7471   bicolor, NULL Uganda   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
GCACTGATGTATTTGATTACCTTACACTATCAGCAATCATTAATGGCCAA
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "69I 7471" genotypes
69I 7776   bicolor, NULL Chad   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "69I 7776" genotypes
74L 11921   bicolor, NULL Central Africa Rep   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GCATGATTATGTGGTTGATTTTTATTTTGACTACATATTTCAATGAGATT
GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "74L 11921" genotypes
Purdue No. 49018   bicolor, NULL Cameroon   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "Purdue No. 49018" genotypes
HD-043   bicolor, NULL Swaziland   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "HD-043" genotypes
PI221607   bicolor, NULL Nigeria   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "PI221607" genotypes
PI267408   bicolor, NULL Uganda   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "PI267408" genotypes
PI267539   bicolor, NULL India   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
GCACTGATGTATTTGATTACCTTACACTATCAGCAATCATTAATGGCCAA
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "PI267539" genotypes
PI585454   bicolor, NULL Ghana   lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
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GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "PI585454" genotypes
BTx623   bicolor, NULL     lga10 CTACGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
GCACTGATGTATTTGATTACCTTACACTATCAGCAATCATTAATGGCCAA
GTAAGTTCCACTAGGGAAAAAATTACAGGTTCTCATTTCATGTTATTTCG
GCAAGTCATACTTAAATTATATGCTGAATTCAGGTCCTCTGTGTTCATGG
TGGTCTTTCTCCCGATGTACGTACTATTGATCAGGTCTGTGA-----CTT
CTGTAACTTTCTTATAACCATCTGTGAACACATCTGTTTATGAACCCTTA
AGTATGACCCTTCCCATTTTATGGGATTCTGAGTTTCATGTCTTTTAGGT
TTGCCA--TACTTGGTGAATACATAAGTAGAAATATTTTTCACATGGACT
ATAAAGGATATGCATAGCCTTAAGAATTACATCTATTTGAAAACTTCACC
ATTATCAGTGATATAAATAAAATGCTTCAGTGGATATATGCTGGAAGTTT
GGAAATTTTGAATATTAAACAGCAGAAATGTTGTTTTCAGTTATTTTGTT
TTTTCTGTTCTTATTTTCAGCTGGTTGTGCTAACTGTACTTTTTT-GGAC
GTGTTTCTGATAGAATTTCCTTTGGTAATAAGAATGCTTATCATCAATGA
ACTAGCATTGCTGACTCATTTTGTGAAGAATATTGAGCACGTGATTCTGG
GGTTGATTTGGTCCTTAGAATTTCTTACTCATTTCTTGAAGAATAGTAGT
GCATGATTATGTGGTTGATTTTTATTTTGACTACATATTTCAATGAGATT
GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "BTx623" genotypes
KFS1   NULL South Africa   lga10 CTATGATGAGTGTCAGAGGAAGTATGGCAACGCCAATGCATGGCGGTACT
GCACTGATGTATTTGATTACCTTACGCTATCAGCAATCATTAATGGCCAA
GTAAGTTCCACTAGGGAAAAAATTACAGGTTCTCATTTCATGTTATTTCG
GCAAGTCATACTTAAATTATATGCTGAATTCAGGTCCTCTGTGTTCATGG
TGGTCTTTCTCCCGATGTACGTACTATTGATCAGGTCTGTGACTTCTCTT
CTGTAACTTTCTTATAACCATCTGTGAACACATCTGTTTATGAACCCTTA
AGTATGACCCTTCCCATTTTATGGGATTCTGAGTTTCATGTCTTTTAGGT
TTGCCA--TACTTGGTGAATACATAAGTAGAAATATTTTTCACATGGACT
ATAAAGGATATGCATAGCCTTAAGAATTACATCTATTTGAAAACTTCACC
ATTATCAGTGATATAAACAAAATGCTTCAGTGGATATATGCTGGAAGTTT
GGAAATTTTGAATATTAAACAGCAGAAATGTTGTTTTCAGTTATTTTGTT
TTTTCTGTTCTTATTTTCAGCTGGTTGTGCTAACTGTACTTTTTT-GGAC
ATGTTTCTGATAGAATTTCCTTTGGTAATAAGAATGCTTATCATCAATGA
ACTAGCATTGCTGACTCATTTTGTGAAGAATATTGAGCACGTGATTCTGG
GGTTGATTTGGTCCTTAGAATTTCTTACTCATTTCTTGAAGAATAGTAGT
GCATGATTATGTGGTTGATTTTTATTTTGACTAAATATTTCAATGAGATT
GAAGCTTTGATTACCTTTTCACCAGATACGAACGATTGATCGCAAT
View all "KFS1" genotypes
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