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Allele data for marker "lge2" from the experiment "Hamblin, Casa, et al. (2006) Challenges of Detecting Directional Selection After a Bottleneck: Lessons From Sorghum bicolor. Genetics 173: 953-964.".

E.g., Germplasm L-WA58, Marker/locus pSB0080.

Items 1 to 18 of 18.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

Country of
Origin

Stock
Number

Locus
name
Genotype
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Germplasm
65I 1633   bicolor, NULL Chad   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "65I 1633" genotypes
65I 1791   bicolor, NULL Mali   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "65I 1791" genotypes
65I 2133   bicolor, NULL India   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
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View all "65I 2133" genotypes
66I 4156   bicolor, NULL Algeria   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "66I 4156" genotypes
66I 4961   bicolor, NULL Kenya   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "66I 4961" genotypes
66I 5133   bicolor, NULL Ethiopia   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "66I 5133" genotypes
69I 7471   bicolor, NULL Uganda   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "69I 7471" genotypes
69I 7776   bicolor, NULL Chad   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "69I 7776" genotypes
74L 11921   bicolor, NULL Central Africa Rep   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
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GATTTGTCAGGTTCTTCTTGGAGATGTGGGTGCTGGCAAATCTAGCTTGG
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "74L 11921" genotypes
Purdue No. 49018   bicolor, NULL Cameroon   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
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GATTTGTCAGGTTCTTCTTGGAGATGTGGGTGCTGGCAAATCTAGCTTGG
TTCTTCGGTTTGTTAAGGGACAGTTTGTTGAATTCCAGGTGAACCTATTG
AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "Purdue No. 49018" genotypes
HD-043   bicolor, NULL Swaziland   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
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GGTTGTTGGTAGAAGTTTTAAGAATTTATGCCCTTTTCTTTTGCGAATTC
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "HD-043" genotypes
PI152702   bicolor, NULL Sudan   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "PI152702" genotypes
PI221607   bicolor, NULL Nigeria   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
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View all "PI221607" genotypes
PI267408   bicolor, NULL Uganda   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "PI267408" genotypes
PI267539   bicolor, NULL India   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
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TTCTTCGGTTTGTTAAGGGACAGTTTGTTGAATTCCAGGTGAACCTATTG
AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "PI267539" genotypes
PI585454   bicolor, NULL Ghana   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
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TTCTTCGGTTTGTTAAGGGACAGTTTGTTGAATTCCAGGTGAACCTATTG
AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "PI585454" genotypes
BTx623   bicolor, NULL     lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACGCCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
ACATGGTGCTTAGCGCGTGGGGTTGTTATGATCGTATACTTCCTTTGCCT
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GATTTGTCAGGTTCTTCTTGGAGATGTGGGTGCTGGCAAATCTAGCTTGG
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AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "BTx623" genotypes
KFS1   NULL South Africa   lge2 CCGCCATCGAATTCGATGGCGGCCAACACCGGGAACAAGATCCGCAACGC
CAAGCTGGTGCGAATTCCTGTCCCGACCGCTCAATTTCAGTTCTTGGTTT
CGCCGCAGATCGAAGCCGGCCGGCCGGATCTTGATCGCCAGTACTGGGAT
ACATGGTGCTTAGCGCGTGGGGTTGTTATGATCGTATACTTCCTTTGCCT
GTGGATTATTGCGTTGCGCCGGGACCAATAGATGGGGTCCTTACTTTTAT
GGTTGTTGGTAGAAGTTTTAAGAATTTATGCCCTTTTCTTTTGCGAATTC
TATATGGATATAAGTGTTTTGACTTCTTGGTAATTTATCCGAAGAGAAAT
AGTAATCGTAACTTTAGCTGGTAAGGTTGTCAAATGTAGAGTTATCAGTT
TAGTTGACCTTTGATACTGGTGGTAACTGAACTCCTAAATGGTCCCTGTT
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TTTGCATTTTAATCATTCGTCATGTGAATGCTAGTGTTTTATTGTATTTT
GATTTGTCAGGTTCTTCTTGGAGATGTGGGTGCTGGCAAATCTAGCTTGG
TTCTTCGGTTTGTTAAGGGACAGTTTGTTGAATTCCAGGTGAACCTATTG
AAATACTTCTCGCGCCGAGAGTGTGGACCAATAGTTTTGTTCTGA
View all "KFS1" genotypes
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