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Allele data for marker "STS006" from the experiment "Genome-wide patterns of nucleotide polymorphism in domesticated rice".

E.g., Germplasm "IRGC9542", RA4969, Basmati 1, Marker/locus RM22.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

Country of
Origin

Stock
Number

Locus
name
Genotype
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Germplasm
Lal Aman IRGC46202 indica   RA4956 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Lal Aman" genotypes
Mudgo IRGC6663 indica   RA5282 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Mudgo" genotypes
Pao-Tou-Hung IRGC51400 indica   RA4992 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Pao-Tou-Hung" genotypes
Pin Kaeo IRGC5803 indica   RA4883 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Pin Kaeo" genotypes
Popot 165 IRGC43545 indica   RA4987 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Popot 165" genotypes
Rathuwee IRGC8952 indica   RA4911 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Rathuwee" genotypes
Tainan Iku 487 PI215936 japonica   RA5286 STS006 CCCCACCTGCCCCTGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Tainan Iku 487" genotypes
Shoemed PI392539 japonica   RA5123 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Shoemed" genotypes
Early Wataribune CIor9738 japonica   RA5319 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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Chinese PI431222 japonica   RA5295 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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Heukgyeong IRGC55530 japonica   RA4973 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
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Kamenoo PI403629 japonica   RA4990 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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Koshihikari IRGC10907 japonica   RA5337 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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Luk Takhar IRGC58286 japonica   RA4977 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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M-202 RA5539 japonica, temperate japonica   RA5539 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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Asse Y Pung CIor461 japonica   RA5333 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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Nep Hoa Vang IRGC40748 japonica   RA4945 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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Norin 20 IRGC418 japonica   RA5302 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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GTTTGCAGCTTT
View all "Norin 20" genotypes
NPE 417 IRGC38692 japonica   RA4944 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "NPE 417" genotypes
Shinriki CIor1642 japonica   RA5327 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Shinriki" genotypes
Shoemed PI392539 japonica   RA5123 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Shoemed" genotypes
Suweon 362 PI597021 japonica   RA5338 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Suweon 362" genotypes
Ta Hung Ku IRGC1107 japonica   RA5029 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Ta Hung Ku" genotypes
Tainan Iku 487 PI215936 japonica   PI215936 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
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View all "Tainan Iku 487" genotypes
Taducan PI280681 indica   RA5374 STS006 CCCCACCTGCCCCGGTTCTTGGAGAGCCGATGGACCTGATGACTGCTCTG
CAGCTTGTGATGAAGAAGTCAAGCGCTCATGATGGGCTCGTGAAGGGGCT
CCGTGAGGCGGCCAAGGCCATTGAGAAGCATGCCGCTCAGCTTTGCGTGC
TTGCTGAGGACTGTGACCAGCCTGATTATGTCAAGTTGGTCAAGGCACTC
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GTCAATTGTTATACTGTGTTAATCTGATGTCTAGGCTGCCGGATAAGATT
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GTTTGCAGCTTT
View all "Taducan" genotypes
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