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Allele data for marker "STS017" from the experiment "Genome-wide patterns of nucleotide polymorphism in domesticated rice".

E.g., Germplasm "IRGC9542", RA4969, Basmati 1, Marker/locus RM22.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

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Stock
Number

Locus
name
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Germplasm
9311 RA5531 indica   RA5531 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "9311" genotypes
Ai-Chiao-Hong IRGC51250 indica   RA4967 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "Ai-Chiao-Hong" genotypes
ARC 13829 IRGC42469     RA4947 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "ARC 13829" genotypes
Arias IRGC43325 japonica   RA4951 STS017 NNTTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGNNN
View all "Arias" genotypes
Asse Y Pung CIor461 japonica   RA5333 STS017 NNTTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGTAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Asse Y Pung" genotypes
Asse Y Pung CIor461 japonica   RA5333 STS017 NNNNNNNNTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGNNN
View all "Asse Y Pung" genotypes
Badkalamkati IRGC45011 indica   RA4991 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Badkalamkati" genotypes
Basmati 217 IRGC53637     RA4993 STS017 NNNTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Basmati 217" genotypes
Binulawan IRGC26872 indica   RA4871 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Binulawan" genotypes
BJ1 IRGC45195     RA5345 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "BJ1" genotypes
Cere Air IRGC43369 indica   RA4953 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "Cere Air" genotypes
Chau IRGC56036 indica   RA4974 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "Chau" genotypes
Chhote Dhan IRGC58930 indica   RA4978 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "Chhote Dhan" genotypes
Chinese PI431222 japonica   RA5295 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "Chinese" genotypes
Cicih Beton IRGC43372 japonica   RA4955 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Cicih Beton" genotypes
DA13 IRGC5857     RA4887 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "DA13" genotypes
Davao IRGC8244 japonica   RA4901 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Davao" genotypes
Davao IRGC8244 japonica   RA4901 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "Davao" genotypes
Dhala Shaitta PI180060     RA5361 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "Dhala Shaitta" genotypes
Dholi Boro IRGC27513 indica   RA4984 STS017 NNTTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Dholi Boro" genotypes
Dom Sufid IRGC12880 aromatic   RA4929 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
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ATGACAGGAAC
View all "Dom Sufid" genotypes
DV85 IRGC8839     RA5323 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
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ATGACAGGAAC
View all "DV85" genotypes
Fortuna CIor1344 japonica   RA5045 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
GCCTTCCAAAGGTTGTTGCTGAGAACTCCATCTTATTAAATTGATTGATA
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ATGACAGGAAC
View all "Fortuna" genotypes
Gotak Gatik IRGC43397 japonica   RA4959 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTGGTA---GCA
GCCATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCCGCTGATTTTGCCAATCGCCG
GCCTTCCAAAGGTTGTTGCTGAGAACTCCATTTTATTAAATTGATTGATA
TGCCTCTGCGGGTTGCACTGTTTCCAGTTCTAAATTTAATATAACTTT-G
TCCTTGCATGATTCTGTTAGGGGTTCTTGAGACATGGCGCAATGCCGATG
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GAACTCGCTGATTTCTGTGGGGCTGGGAAGGCTGTTGCTGAGTGGACTTC
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ATGACAGGAAC
View all "Gotak Gatik" genotypes
Guan-Yin-Tsan IRGC51300 indica   RA4968 STS017 CATTTCTTTCTGCTAAACTTTGCAAGACTCGTCCCCTGGTAGTAGCAGCA
GCTATGGAGGTCTCGAAGGAAGCCCCTTCTGCTGACTTTGCCAATCGCCA
GCCTTCCAAAGGTTGTTGCTGAGAACTCCATCTTATTAAATTGATTGATA
TGCCTCTGCGGGTTGCACTGTTTCCAGTTCTAAATTTAATATAACTTTTG
TCCTTGCATGATTCTGTTAGGGGTTCTTGAGACATGGTGCAATGCCGATG
CAGTGTGTTTTGATGTTGATAGCACGGTCTGCTTGGATGAGGGTATTGAT
GAACTCGCTGATTTCTGTGGGGCTGGGAAGGCTGTTGCTGAGTGGACTGC
AAAGTAAATAACATGTTATGAACATTAGTTTTGAAGTGTGTTTGTTGCTT
AGTGCATAAAATTCATTCAGGATGCTCATTGGTTTAATATTCTTAGGGCA
ATGACAGGAAC
View all "Guan-Yin-Tsan" genotypes
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