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Allele data for marker "STS031" from the experiment "Genome-wide patterns of nucleotide polymorphism in domesticated rice".

E.g., Germplasm "IRGC9542", RA4969, Basmati 1, Marker/locus RM22.

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Germplasm
Accession Name

Germplasm
Accession
Number

Subsp.
& subtaxa

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Stock
Number

Locus
name
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Germplasm
9311 RA5531 indica   RA5531 STS031 NNNNCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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View all "9311" genotypes
Ai-Chiao-Hong IRGC51250 indica   RA4967 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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View all "Ai-Chiao-Hong" genotypes
ARC 13829 IRGC42469     RA4947 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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View all "ARC 13829" genotypes
Arias IRGC43325 japonica   RA4951 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Asse Y Pung CIor461 japonica   RA5333 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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View all "Asse Y Pung" genotypes
Asse Y Pung CIor461 japonica   RA5333 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Badkalamkati IRGC45011 indica   RA4991 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Basmati 217 IRGC53637     RA4993 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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View all "Basmati 217" genotypes
Binulawan IRGC26872 indica   RA4871 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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BJ1 IRGC45195     RA5345 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAATTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Cere Air IRGC43369 indica   RA4953 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAATTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Chau IRGC56036 indica   RA4974 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Chhote Dhan IRGC58930 indica   RA4978 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Chinese PI431222 japonica   RA5295 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Cicih Beton IRGC43372 japonica   RA4955 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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DA13 IRGC5857     RA4887 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Davao IRGC8244 japonica   RA4901 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Davao IRGC8244 japonica   RA4901 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Dhala Shaitta PI180060     RA5361 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Dholi Boro IRGC27513 indica   RA4984 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTACCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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Dom Sufid IRGC12880 aromatic   RA4929 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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View all "Dom Sufid" genotypes
DV85 IRGC8839     RA5323 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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TGTCCTTCTTTACGGGCCTCCGGGTACAGGAAAAACGCTACTAGCTCGGG
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View all "DV85" genotypes
Early Wataribune CIor9738 japonica   RA5319 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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View all "Early Wataribune" genotypes
Fortuna CIor1344 japonica   RA5045 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
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TGTCCTTCTTTACGGGCCTCCGGGTACAGGAAAAACGCTACTAGCTCGGG
CAGTTGCTCATCACACCGACTGTACCTTTATTAGGGTGTCAGGTTCCGAG
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GCATGCACCATCCATAATCTTTATGGATGAAATAGACTCCATTGGATCTG
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Gotak Gatik IRGC43397 japonica   RA4959 STS031 ATTGCCCAGCCAAAGGTTAGAACTTGTTTATCAGTTTGCATTTTGTTTGG
TATCAACTGTCATTATTAGTGGAAAATATTCACCTTTGATTTTTGCAGGG
TGTCCTTCTTTACGGGCCTCCGGGTACAGGAAAAACGCTACTAGCTCGGG
CAGTTGCTCATCACACCGACTGTACCTTTATTAGGGTGTCAGGTTCCGAG
TTGGTTCAGAAGTATATTGGAGAGGGTTCCAGAATGGTTCGTGAACTATT
TGTGATGGCCAGGTAAACATTTTCTGTTGATGATACATTGAAATTTACCA
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CTTTACACTATTCAGTAGGCTGACGTCTTTGGTTTGAATTTTGACAGAGA
GCATGCACCATCCATAATCTTTATGGATGAAATAGACTCCATTGGATCTG
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View all "Gotak Gatik" genotypes
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